Uppgifterna kommer från en rapport framtagen av den kristna hjälporganisationen Open Doors. Mellan februari och september i år registrerades 743 attacker mot kristna och 10 fall där yazidier var offer på tyska asylboenden.
Vissa av dem som utsattes för övergrepp var barn, det yngsta endast fem år gammalt, och de drabbade utsattes för alltifrån sexuella ofredanden till dödshot.
Muslimer, asylsökare men i många fall även anställda på asylboendena, pekas ut som förövare. 28 procent av dem som drabbades uppgav att det var muslimsk vaktpersonal som låg bakom övergreppen.
Peter Paulsson, generalsekretetare för den svenska grenen av Open Doors, tror att det ser likadant ut på svenska asylboenden. Han är kritisk till naiva europeiska migrationsmyndigheter som blandar olika asylsökare med varandra.
– Islamistisk extremism är på frammarsch. Rapporten visar att en stor majoritet av befolkningen i flera länder vill införa sharialagar. Och så tar man en handfull kristna och muslimer och placerar dem på samma flyktingförläggning, säger han till Världen Idag.
Enligt Open Doors är det endast ett fåtal av övergreppen som anmäls till myndigheterna. De tror också att det finns ett stort mörkertal och att det i praktiken rör sig om tusentals kristna asylsökare som utsätts för övergrepp av muslimer på asylboenden runt om i Tyskland.
Hjälporganisationen uppmanar nu de tyska myndigheterna att anställa fler icke-muslimer som vakter på asylboendena. Organisationen beskyller även politikerna för att "experimentera" med att blanda asylsökare med olika etnisk och religiös bakgrund med varandra i förhoppning om att det ska integrera dem bättre.