Kyrkomötet är Svenska kyrkans högsta beslutande organ.
Inför mötet i november hade Sverigedemokraterna, som sitter på 24 mandat, lagt en motion om att Svenska kyrkan ska ha en kritisk hållning till islamska böneutrop.
Motionen röstades dock ned med stor majoritet
206 röstade emot och 26 för.
Bland de som argumenterade emot motionen fanns Artemis Lumarker från Öppen kyrka, en nomineringsgrupp inom Svenska kyrkan.
– Tänk vad fantastiskt att fler får möta både Allahs och Guds kärlek, och vad vi får ut i mötet med varandra, sade han enligt Dagen och påstod även att SD försöker "avhumanisera" andra människor.
Öppen kyrka verkar för en "vision om en öppen kyrka där alla människor är välkomna", skriver man på sin hemsida.
Diskussionen ska ha engagerat en rad personer under mötet.
På andra sidan fanns Sverigedemokraternas Aron Emilsson, som menade att Svenska kyrkan gör avkall på sin egen tro genom att stödja böneutrop. Att göra det ska inte vara kyrkans uppgift, menade han.
Hans partikollega Camilla Berard Granström hävdade att islam har spridits snabbare med hjälp av Svenska kyrkan.
Socialdemokraten Isak Öhrlund förklarade å andra sidan att kyrkan ska vara en "en progressiv och öppen kraft" i samhället, skriver Dagen, och därför kan man inte vara kritisk till böneutrop.