I uppdraget ingår att ta fram en process för hur och med vilka metoder åldersbedömningar ska genomföras.
Redan idag genomför Rättsmedicinalverket medicinska åldersbedömningar, men endast på uppdrag av åklagare och polis.
Myndighetens generaldirektör Monica Rodrigo säger sig välkomna beslutet.
– Att fastställa om en asylsökande är barn eller vuxen är viktigt av flera skäl. Ensamkommande barn ska till exempel inte behöva bo med vuxna under asylprocessen och har rätt till särskild omvårdnad, säger Monica Rodrigo i ett pressmeddelande.
Senast den 15 november i år ska Rättsmedicinalverket redovisa hur medicinska åldersbedömningar ska se ut framöver.
– Det är angeläget att vi får ett system på plats snabbt. Rättsmedicinalverket har god vana av att utföra denna typ av bedömningar och deras erfarenhet borgar för god kvalitet och rättsäkerhet, säger justitie- och migrationsminister Morgan Johansson i ett pressmeddelande.