I insatsen mot de två bröderna – Anas Kiwan, 29, och Ahmad Kiwan, 24 – i våras deltog 250 tyska poliser.
Nu åtalas duon vid en domstol i Hamburg för terrorbrott.
Den äldre brodern misstänks ha planerat en muslimskt motiverad bombattack riktad mot en kyrka i Sverige.
Attacken skulle att genomföras vid en tidpunkt då det var fullt med folk i kyrkan och uppges ha planerats som ett svar på koranbränningar som ägt rum i Sverige.
Hans yngre bror, 24 år gammal, ska enligt åtalet ha lovat att delta i en attack på uppdrag av IS och dessutom hjälpt sin bror att skaffa sprängmedel.
De båda bröderna greps tidigare i år, i april. Vid gripandet av den 29-åringen hittades två kilo gödsel och citronsyra, och han ska också ha inväntat en leverans av blekmedel. Detta skulle användas för att skapa sprängmedel, enligt åtalet.
Den äldre brodern ska ha fått hjälp av en tredje IS-kopplad person som dock inte kunnat identifieras.
– Han har försökt hjälpa den äldre brodern och lärt honom om explosiva varor men vi vet inte hans identitet och har därför inte kunnat gå vidare med honom, säger åklagaren Liddy Oechtering till SVT Nyheter.
