Varningen, som uppdaterades under måndagen, kommer stora mängder regn falla i Stockholms län, bortsett från Roslagskusten, under lördagen.
En klass 1-varning för stora regnmängder innebär minst 35 mm regn inom loppet av tolv timmar. Regnmängderna innebär risk för stora vattensamlingar, överfyllda dagvattenledningar och översvämmade källare.
Lokal kommer upp till 60 mm regn falla, uppger SMHI.
Samtidigt som stockholmarna blir blöta har SMHI utfärdat varningar för skogsbränder i norra Västergötland, Värmland samt Västkusten från Bohuslän i norr till Skåne i söder utom Österlen.