Ett luxuöst hotellkomplex som ägs av Kolomojskyjs bank PrivatBank konfiskerades på måndagen av myndigheterna på Krim, med hänvisning till att oligarken finansierar terrorism i östra Ukraina.
Nu har dessutom Ihor Kolomojskyjs egendom i Moskva beslagtagits, enligt den ryske utredningskommitténs talesman Vladimir Markin.
Han menar att kommittén nu utreder grova och ytterst grova brott som begåtts i regionerna Donetsk och Luhansk i Ukraina, rapporterar The Moscow Times.
Företaget som Kolomojskyj är medgrundare till äger en kontorsbyggnad i Moskva. Pengarna man fick för uthyrningen användes enligt de ryska myndigheterna för att finansiera brott i sydöstra Ukraina.
Utredarna försöker nu fastställa vart hyresvinsterna och försäljningstillgångarna har tagit vägen. Man utesluter inte att pengarna kan ha spenderats på att backa upp brottslig verksamhet i östra Ukraina.
Ihor Kolomojskyj utnämndes efter statskuppen tidigare i år till guvernör i Dnipropetrovsk. Han uppges finansiera privata nationalistiska milisgrupper som slåss mot de proryska separatisterna i de östra delarna av landet.
Tidigare i somras inleddes ett åtal mot oligarken i Moskva. Kolomojskyj misstänks för mord, kidnappning och andra grova brott.
I maj fick Hunter Biden, son till USA:s viceprecident, ett toppjobb på gasjätten Burisma Holdings, som kontrolleras av Ihor Kolomojskyj.