Salwan Momika, som tidigare uppmärksammats för sina koranbränningar, genomförde en tillståndsgiven manifestation vid Irans ambassad på Lidingö på fredagen.
När Momika tänt eld på koranen rusade plötsligt en kvinna fram med en brandsläckare och började spruta med den mot honom.
Polisen omhändertog kvinnan, som nu är misstänkt för störande av allmän förrättning samt våld mot tjänsteman.
Säkerhetspolisen har höjt hotnivån mot Sverige till en fyra på den femgradiga skalen på grund av ökad risk för muslimska terrordåd efter koranbränningarna.
Ingen skadades under händelsen, men poliser som exponerades för brandsläckarpulver undersöktes av sjukvårdspersonal, enligt SVT.
Polisen kommer också att inleda en utredning om hets mot folkgrupp på grund av misstankar om att detta åsiktsbrott begicks vid den allmänna sammankomsten.