I debattartikeln, som publicerades i fredags, lade Wallström skulden för krisen i Ukraina på Ryssland. Hon anklagade också den ryska militärmakten för att vara direkt involverad i striderna.
"Jag känner stor oro inför utvecklingen i Ryssland. Detta viktiga grannland har stor potential, och kunde på så många områden varit en viktig partner för Sverige och EU. I stället får vi nu en motsatt verklighet", skrev utrikesministern.
I ett bemötande på Facebook skriver Rysslands ambassad i Sverige att Wallströms debattartikel är "av en ensidig karaktär".
"Den saknar det viktiga – orsaken som givit upphov till hela ukrainska händelseförloppet. Nämligen västs vilja, inte minst Sveriges som initiativtagare till EU:s Östliga partnerskap, att på alla sätt driva igenom Kiev i Europeiska unionen", skriver ambassaden.
Västvärldens huvudverktyg för att få sin vilja igenom i Ukraina visade sig enligt bemötandet bli "en statskupp, ett våldsamt maktskifte" som drev in Ukraina i en avgrund.
"Som man brukar säga i Ryssland, 'skall man börja från första början' men inte på ett trångsynt och subjektivt sätt tillpassa fakta till ett i förväg förberett scenario och anklaga Ryssland för alla 'dödssynder'", skriver den ryska ambassaden i inlägget.
Artikeln är rättad: Sveriges utrikesminister heter Margot Wallström och inget annat.