"De omkomna är en man i 70-åldern hemmahörande i Stockholmsregionen, och en man i 60-års åldern bosatt utomlands", skriver UD i ett mejl till Aftonbladet.
Den svensk som skadats och vårdas på sjukhus är en man i 70-årsåldern.
Skottlossningen inträffade klockan 19.15 på måndagen, ungefär en och en halv timme före Sveriges EM-kvalmatch i fotboll mot Belgien i Bryssel.
Efter dådet höjdes terrorhotnivån i Bryssel till den högsta på skalan och säkerheten skärptes i centrala Bryssel.
Den svenska säkerhetspolisen följer utvecklingen. Terrorhotnivån i Sverige höjdes nyligen till en hög nivå, en fyra på den femgradiga skalan. Den bedömningen står fast.
– Det är ett fruktansvärt dåd och mina tankar går till de anhöriga. Vi står i nära kontakt med säkerhetspolisen och belgisk polis, säger Anders Thornberg, rikspolischef, i ett utspel.