Ristningarna, som fanns vid en känd arkeologisk plats vid berget Toubkal, är över 8 000 år gamla. De skildrade solen som en hednisk gudomlighet, vilket inte gillades av de muslimska fundamentalisterna.
Enligt AFP är det så kallade salafister som ligger bakom förstörelsen.
I regionen har flera liknande händelser inträffat på kort tid. I Tunisien brändes ett sufiskt mausoleum ned på måndagen. I norra Mali har flera helgedomar uppsatta på Unescos världsarvslista förstörts, skriver AFP.