Videoklipp i sociala medier visar personer som klättrar upp på ambassadens balkonger, sätter eld på flaggor, viftar med koraner och skriker.
Man ser också hur rök stiger från en av byggnaderna.
Säkerhetsstyrkor och vattenkanoner sattes in för att hantera situationen.
NOW - Swedish embassy in #Baghdad set on fire. pic.twitter.com/J33GKJlbkr
— Disclose.tv (@disclosetv) July 20, 2023
Det hela sker efter att polisen i Stockholm beviljat tillstånd för en koranbränning utanför Iraks ambassad på torsdagen. Enligt Reuters ska stormningen ha skett efter att shiapredikanten Muqtada al-Sadr uppmanat sina anhängare att demonstrera.
Ambassaden stormades även den 29 juni efter koranbränningen vid Stockholms moské.
UD säger sig vara underrättad om situationen.
"Vår ambassadpersonal befinner sig i säkerhet och UD står i löpande kontakt med dem. Vi fördömer alla attacker på diplomater och personal från internationella organisationer. Attacker mot ambassader och diplomater utgör ett allvarligt brott mot Wienkonventionen. Irakiska myndigheter bär ansvaret för att skydda de diplomatiska beskickningarna och diplomatisk personal."
Även Iraks utrikesdepartement tar avstånd från den nya stormningen.
"Utrikesdepartementet fördömer i starka ordalag handlingen där Sveriges ambassad i Bagdad sattes i brand", skriver man i ett uttalande.