Lars Westermark, lokalpolisområdeschef i Skellefteå, säger enligt P4 att pojken har flyttats på grund av den "hätska stämningen kring händelsen på sociala medier och att det är en trygghetsskapande åtgärd".
– Det finns en hotbild mot pojken och hans familj och det finns en oro bland dem som bor i området, säger Lars Westermark till TT.
Den misstänkte afrikanen är på papperet 13 år, men åklagaren misstänker att han i själva verket är straffmyndig.
Efter dådet i Skellefteå den 7 juli vårdas flickan ännu på sjukhus och det planeras i nuläget inte för något förhör med henne.
Den misstänkte är hörd vid två tillfällen och en utredningen om han hade fyllt 15 år vid tidpunkten för gärningarna pågår.
Åklagaren har beslutat att en medicinsk åldersbedömning ska genomföras. Om det efter genomförd åldersbedömning är klarlagt att den misstänkte hade fyllt 15 år vid tillfället kan det bli aktuellt med åtal. Resultatet väntas vara klart tidigast i mitten av augusti, enligt Åklagarmyndigheten.
Den tekniska utredningen i ärendet, bestående bland annat av spår säkrade på brottsplatsen, kommer sannolikt inte vara klar före september månad. Ärendet handläggs dock med hög prioritet.