"All fakta kring detta är inte klarlagd, men om uppgifterna stämmer är det alldeles fasansfullt", skriver statsminister Ulf Kristersson i en kommentar till media.
"Mina tankar är hos offret, den lilla killen och deras anhöriga", fortsätter han.
Statsministern hävdar att regeringen är besluten att bekämpa gängbrottsligheten.
"Den systemhotande brottslighet som vårt land nu upplever har brutala konsekvenser för hela vårt fria och öppna samhälle. Människor med våldskapital ska inte tillåtas skrämma hederliga medborgare till tystnad."
Enligt medieuppgifter var pappan i Skärholmen med sin tolvårige son på väg till badhuset tidigt på onsdagskvällen. Vid en gångtunnel konfronterade han ett stökigt gäng och ska då ha skjutits i huvudet, varpå han avled.
SD-ledaren Jimmie Åkesson har kommenterat händelsen med att slå fast att det nu är dags att "förklara krig" mot samtliga gängmedlemmar.