Fathimath Shamnaz Ali Saleem greps förra helgen tillsammans med två andra personer i huvudstaden Malé, meddelade polisen nu i veckan.
Klimatministern har suttit häktad i en vecka i väntan på ytterligare utredningsåtgärder.
Lokalmediet Sun rapporterar att Fathimath Shamnaz Ali Saleem anklagas för att ha använt "svart magi" mot president Dr. Mohamed Muizzu. Polisen har dock varken bekräftat eller avfärdat dessa uppgifter.
Maldiverna är ett land med muslimsk majoritet. Även om trolldom inte är ett brott enligt den nationella strafflagen kan det resultera i sex månaders fängelse enligt islamisk lag.
Maldiverna har en historia av incidenter som involverar påstådd svart magi. År 2012 avbröt polisen ett politiskt oppositionsmöte och anklagade arrangörerna för att ha kastat en "förbannad tupp" på poliser under en razzia.
I april 2023 mördades en 62-årig kvinna på Manadhoo av tre grannar som anklagade henne för att ägna sig åt svart magi. En utdragen polisutredning fann dock inga bevis som stödde påståendena om trolldom mot offret.
Maldiverna har också varit i centrum när det gäller det så kallade klimatet, eftersom klimataktivister har varnat för att öriket snart kommer att hamna (eller redan borde ha hamnat) under vattenytan.