– I september kommer vi att veta vad som orsakat autismepidemin och kunna eliminera de exponeringarna, sade Kennedy under ett kabinettmöte i torsdags enligt BBC News.
Ministern, som är känd för att ifrågasätta vaccin och driva alternativa hälsoteorier, säger att forskningsprojektet ska omfatta hundratals vetenskapsmän från hela världen.
Han har dock inte presenterat några detaljer om hur mycket resurser som ska satsas, samtidigt som han nyligen skurit ned på budgeten för flera statliga hälsomyndigheter.
Enligt Kennedy kommer man att titta på vacciner – men även på andra faktorer som mat, vatten, luft, föräldraskap och andra förändringar i samhället som kan ha påverkat förekomsten av autism.
Vetenskapliga experter har dock kallat Kennedys utspel för orealistiskt och missvisande. Autism Society of America menar att påståendena bidrar till skadliga stigman och vilseleder allmänheten om vad autism faktiskt är.
"Det är varken en kronisk sjukdom eller en smitta", skriver organisationen i ett uttalande.
Samtidigt har Kennedy väckt uppståndelse genom att anlita David Geier – en av landets mest ökända vaccinskeptiker – till sin forskningsgrupp.
Enligt amerikanska myndigheter ligger autismdiagnoserna nu på cirka 2,77 procent bland åttaåringar, en ökning som officiellt förklaras med bredare diagnoskriterier och ökad medvetenhet.