Farkostens pilot lyckades rädda sig själv med fallskärm medan andrepiloten omkom i olyckan, som uppges ha varit någon form av explosion.
"Under testet drabbades farkosten av en allvarlig anomali som resulterade i förlust av farkosten", skriver företaget på sin hemsida.
Företaget uppger dessutom att företagets grundare och huvudägare, den brittiske mångmiljardären Richard Branson, är på väg till USA för att på plats informera sig om olyckan.
Virgin galactic är ett företag, grundat 2004, med rymdturism som affärsidé. SpaceShip Two var tänkt att ta sex passagerare åt gången på flygturer på höjder över 100 kilometer, den så kallade Karmanlinjen som enligt FAI utgör gränsen mellan atmosfären och yttre rymden.