"Jag har inför höstens nomineringsprocess meddelat KDU:s valberedning att jag inte ställer upp för omval", skriver hon.
Skyttedal, som fyller 30 nästa månad, förklarar att hon vill lämna över till någon som kan leda ungdomsförbundet igenom valrörelsen.
"Under min tid som ordförande har det skett omvälvande förändringar i omvärlden och det politiska landskapet har transformerats", konstaterar Skyttedal.
Skyttedal tog över som förbundsordförande i maj 2013. Under hennes ledning har ett flertal politiskt kontroversiella utspel gjorts. Så sent som i mars i år pratade hon om den så kallade "asylrätten" och sin syn på invandring.
– "Värna asylrätten" är den heliga ko som kommer slaktas under 2016, slog hon fast då.
Förra sommaren krävde KDU att den så kallade "decemberöverenskommelsen", en maktkartell mellan den rödgröna regeringen och de borgerliga partierna, skulle rivas upp.
Kartellen föll senare samma år efter att moderpartiet hoppat av den. Sedan dess har dock Stefan Löfven tillåtits sitta kvar vid makten eftersom de borgerliga partierna inte velat eller vågat fälla honom i en misstroendeomröstning.