"Sammantaget bedömer Säkerhetspolisen att koranbränningar i sig ökat och framöver kan komma att öka, attentatshotet mot Sverige och svenska intressen på kort sikt", skriver Polisregion Stockholm i sitt beslut.
Den allmänna sammankomsten skulle enligt ansökan ha ägt rum i måndags utanför Iraks ambassad.
Några dagar innan stoppade polisen, efter "dialog med Säkerhetspolisen", en annan planerad koranbränning utanför Turkiets ambassad.
Enligt SVT konstaterar Polismyndigheten i båda dessa fall att det inte finns något som tyder på att allvarliga störningar skulle kunna uppstå vid själva protesterna.
Säpos agerande kritiseras av justitieutskottets ordförande Richard Jomshof (SD).
"Att en medborgare nekas att utöva sina demokratiska fri- och rättigheter är allvarligt. Vi kan inte under några som helst omständigheter låta islamister och terrorister sätta gränserna för vår yttrandefrihet", skriver han på Twitter.
