Bakgrunden till den tyska protesten är den nya antipedofillag som den ungerska regeringen förbereder och som kriminaliserar homo- och transsexuell propaganda riktad mot barn.
I ett partiöverskridande uttalande från kommunfullmäktige München skriver politikerna att de "bekänner sig til mångfald, tolerans och verklig jämlikhet i idrotten och i samhället som helhet".
Münchens socialdemokratiska borgmästare Dieter Reiter uppger att han i början av nästa vecka kommer att kontakta Uefa och Tysklands fotbollsförbund för att få till den regnbågsfärgade arenan till på onsdag.
Kommunfullmäktige har också beslutat att även rådhuset ska flagga med regnbågsfärdger, i "solidaritet med HBTQ-miljön i Ungern".
Tyska HBTQ-orgaisationer hyllar politikernas initiativ, skriver Die Welt.