Manafort var under många år rådgivare åt Ukrainas förre president Viktor Janukovytj som tvingades bort från makten i en västunderstödd statskupp 2014.
Att kampanjchefen för en presidentkandidat engagerat sig till stöd för ett annat lands statschef som Vita huset motarbetat är mycket känsligt i USA. AP avslöjade dessutom i torsdags mejlkorrespondens som visar att Manafort även försökt påverka amerikanska lagstiftare och opinionen i landet till stöd för Janukovytj.
För att kunna bedriva sådant lobbyarbete för främmande makt krävs att man registrerar sig hos de amerikanska myndigheterna för att tydliggöra sina ambitioner och vem uppdragsgivaren är, något som Manafort aldrig gjorde. Han riskerar nu åtal och upp till fem års fängelse.
Manafort har en lång bakgrund inom Republikanerna och har tidigare varit rådgivare åt presidenter som Gerald Ford, Ronald Reagan och George H. W. Bush samt presidentkandidaten Bob Dole. Han har även engagerat sig internationellt och anklagas för att ha stöttat diktatorer i Afrika och Asien.
Donald Trump uttryckte i ett uttalande besvikelse över att hans kampanjchef tvingas hoppa av och kallar Manafort för "riktigt professionell".
– Jag är väldigt tacksam för hans fantastiska arbete och att han hjälpt oss dit vi är idag, i synnerhet hans arbete med att leda oss genom processen med delegater och kongressen, säger han.