Utrikesministern Javad Zarif skriver på Twitter att landets väpnade styrkor har genomfört en preliminär utredning som visar att planet sköts ned på grund av ett mänskligt misstag.
Han konstaterar samtidigt att det skedde under en kristid som "orsakats av USA:s äventyrlighet" och som ledde till katastrof.
"Vi vill meddela vår djupaste ånger, be om ursäkt och ge våra kondoleanser till vårt folk, offrens familjer och andra drabbade länder", skriver Zarif.
Ukrainas president Volodymyr Zelensky har lämnat ett uttalande där han skriver att även om denna morgon inte förde med sig några goda nyheter, så förde den i alla fall fram sanningen. Ukraina räknar nu med att de ansvariga ställs till svars, och Iran har meddelat att de kommer att ställas inför en nationell militär domstol.
Hur olyckan kunde inträffa är fortfarande oklart, då planet precis hade börjat stiga från en civil flygplats när det sköts ned.