Khalid Sheikh Mohammed och de två misstänkta kumpanerna – Walid Muhammad Salih Mubarak Bin Attash och Mustafa Ahmed Adam al Hawsawi – har suttit fängslade på den ökända amerikanska Guantanamobasen på Kuba i 23 år.
Beskedet om att de inte kommer att avrättas väcker starka reaktioner från offrens familjer, som har väntat i nästan 24 år på ett rättslig avslut, rapporterar New York Post.
I utbyte mot att att slippa dödsstraff har de tre anklagade gått med på att erkänna sig skyldiga till samtliga anklagelser, inklusive mord på de 2.976 personer som omnämns i åtalet.
Daniel D’Allara, vars tvillingbror John var en av de 23 New York-poliser som dödades under attackerna, uttrycker sin besvikelse:
– Jag är väldigt besviken. Vi har väntat tålmodigt under en lång tid. Jag ville ha dödsstraff – staten har svikit oss, säger han till New York Post.
Terry Strada, nationell ordförande för anhörigorganisationen 9/11 Families United, säger att vissa anhöriga vill se en slut på den långdragna processen, men att hon personligen ville se en rättegång där de skyldiga dömdes och straffades i enlighet med det brott de anklagas för.
Den pensionerade polisen Jim Smith var gift med Moira Smith, den enda kvinnliga polis som dog den 11 september. Han säger att det känns om han fått en "pungspark".
– De begick det värsta brottet i vårt lands historia. De borde få det högsta straffet, säger han till New York Post.
Det är fortfarande oklart var tre männen kommer att avtjäna sina straff efter sina erkännanden.