Branden, som bröt ut under en spelning med hiphop-gruppen DNA natten mot söndag, tros ha orsakats av pyroteknik som antände scendekoren och innertaket.
Enligt myndigheterna befann sig minst dubbelt så många personer i lokalen än vad som var tillåtet. Panik utbröt när gästerna försökte fly, vilket bidrog till det höga dödstalet.
– Det finns stora frågetecken kring hur säkerheten har sett ut, säger SVT:s utrikesreporter Carl Fridh Kleberg på plats i Kocani.
Polisen har gripit nattklubbens ägare och ett femtontal personer har tagits in till förhör. Inrikesminister Panche Toshkovski bekräftar att mutor och korruption kan ha spelat en roll i katastrofen.
– Vi har skäl att misstänka att mutor och korruption är inblandat i fallet, sade han på en presskonferens.
Olyckan har väckt stor ilska bland invånarna i Kocani, där många ifrågasätter hur klubben kunde få tillstånd att bedriva verksamhet.
– Hur har det gått till när de fått tillstånd, hur många har vistats i lokalen, andra möjliga missförhållanden, säger Carl Fridh Kleberg.
En boende i staden uttrycker både bestörtning över tragedin och ett bredare missnöje med myndigheterna.
Utredningen pågår och myndigheterna har lovat en grundlig genomgång av säkerhetsrutiner och eventuella regelbrott.