Utbrottet är koncentrerat till landets sydvästra provins Kwango där minst 376 personer har insjuknat sedan slutet av oktober, enligt uppgifter från FluTrackers.com som hänvisar till lokala källor.
De drabbade uppvisar symtom som hög feber och svåra huvudvärkar, rapporterar Reuters.
Kvinnor och barn, särskilt tonåringar, verkar vara de som drabbas hårdast. Enligt hälsoministeriet är de flesta döda mellan 15 och 18 år.
Provinsens viceguvernör Rémy Saki säger till AP att ett team av epidemiologiska experter ska resa till området för att samla in prover och utreda sjukdomen.
Förra veckan underrättade landet Världshälsoorganisationen (WHO) om utbrottet, enligt Centrum för forskning och policy om infektionssjukdomar vid Minnesotas universitet. WHO säger att utbrottet är "extremt allvarligt" men får mothugg av den svenska Folkhälsomyndigheten, som tonar ned riskerna i en intervju med Ekot.
– Man ska ju veta att både vi och internationella myndigheter verkligen har ögonen på såna här saker, och ser till att om det skulle bli en epidemi så är man snabbt där och hanterar det på plats, säger statsepidemiolog Magnus Gisslén till radion.
Samtidigt som myndigheterna kämpar för att identifiera sjukdomen hanterar Kongo även ett annat pågående utbrott av apkoppor, som sprids bland homosexuella män även i västvärlden.
Under 2023 rapporterade landet över 14.000 fall av apkoppor och 650 dödsfall – de högsta siffrorna inom WHO:s afrikanska region.
