Åtalet inkluderar även anklagelser om att de misstänkta svurit trohet till terrororganisationen IS i Somalia.
Enligt kammaråklagare Lars Hedvall bygger åtalet på omfattande bevis, bland annat ljudupptagningar och material från de misstänktas telefoner.
– De har fått instruktioner och råd från IS i Somalia, säger Hedvall till SVT.
En av bröderna har tidigare delat jihadistisk propaganda på sociala medier, däribland en profilbild med anknytning till en kanal för Islamiska staten, enligt SVT.
De misstänkta ska ha haft kopplingar till en lokal som används av en islamisk förening i Tyresö. Stora delar av bevismaterialet har säkrats från denna lokal, och Säpo har använt hemliga tvångsmedel som en del av utredningen.
– Ärendet har varit omfattande och misstankarna rör kopplingar till såväl den internationella terroristorganisationen IS som till den grova organiserade brottsligheten i Sverige. Utredningen har bedrivits i nära samverkan med flera nationella och internationella partners och, inte minst, Polismyndigheten, säger Fredrik Hallström, operativ chef vid Säkerhetspolisen.
Den förundersökning som ligger till grund för åtalet har bedrivits av Säkerhetspolisen under ledning av åklagare vid Riksenheten för säkerhetsmål.