Trumps beslut rör medlemmar i den kontroversiella så kallade 6 januari-kommittén, som tillsattes av Demokraterna i kongressen för att utreda protesterna vid Kapitolium den 6 januari 2021.
I ett inlägg på sin plattform Truth Social uppger Trump att de benådade personerna nu ska utredas.
Han antyder också att kommittémedlemmarna i själva verket såg till att benåda sig själva utan att Biden kände till det.
"Med andra ord, Joe Biden undertecknade dem inte, men ännu viktigare: han visste ingenting om dem!" skriver Trump och fortsätter.
"De nödvändiga benådningsdokumenten förklarades inte för Biden och godkändes inte av honom. Han visste ingenting om dem, och de som gjorde detta kan ha begått ett brott."
Amerikanska medier har inte bekräftat att Vita huset verkligen använde en autopen, och Biden-administrationen har ännu inte kommenterat Trumps påståenden. Det som föregick Trumps utspel var dock att den konservativa tankesmedjan Heritage Foundation genomfört en analys av Bidens underskrifter och funnit att hans benådningar den 19 januari alla hade "exakt" samma autopen-signatur.
"Vem ligger bakom denna autopen?" frågar sig tankesmedjan.
Donald Trump benådade själv nyligen, i samband med att han tillträdde som president, en lång rad personer som dömts för sin inblandning i protesterna den 6 januari 2021.
