Djurplågeriet upptäcktes av en veterinär den 30 juni som såg hur ett antal lamm slaktades av en särskilt inhyrd muslimsk slaktare, trots att de inte var tillräckligt bedövade.
"Det beskrivna förfarandet har utsatt berörda djur för en svår stress och ett lidande som inte är försumbart", skriver veterinären i en rapport.
Efter att veterinären slagit larm har Livsmedelsverket valt att gå vidare med fallet till åklagare som brott mot djurskyddslagen. Den person på Siljans Chark som genomförde halalslakten har fått sparken från företaget.
– Jag kallade upp personen morgonen efter och bad personen att lämna slakteriet och entledigade denna från uppdraget, säger slakterichefen Runar Gustafsson.
Vid halalslakt dödas djuret genom att halspulsådern sprättas upp och djuret därefter dör av den kraftiga blodförlusten. Samtidigt mumlar en imam eller särskilt initierad muslimsk man en besvärjelse över djuret.
I Sverige är halalslakt tillåtet om djuret bedövats innan slakten. Många muslimer uppges acceptera kompromissen medan andra föredrar kött som importerats från länder där riktig halalslakt utan bedövning är tillåten.
På Siljans Charks Facebooksida är det många som är upprörda över att företaget sysslar med halalslakt. Slakteriet slaktar 6.500 lamm varje år och köparen av de slaktade djuren kräver att de slaktas i enlighet med muslimsk sed.