Den 24-årige mannen är svensk medborgare med libanesiskt ursprung och greps den 7 juli av cypriotiska myndigheter misstänkt för förberedelse av terrorbrott, uppger flera medier.
?Vi kan bekräfta att en 24-årig man av utländsk härkomst har gripits för specifika, allvarliga brott, och nu är i förvar på domstolens begäran, säger Andreas Angelides, talesman för svenska polisen som citeras av Reuters.
Enligt lokal TV har mannen sagt att han är medlem i den islamistiska organisationen Hizbollah. Den israeliska tidningen Haaretz skriver att mannen planerade att spränga en buss eller et flygplan, med många israeler på.
Den israeliska säkerhetstjänsten Mossad tipsade cypriotisk polis om att mannen planerade en attack och cypriotiska poliser stormade senare in på mannens hotellrum i Limassol på södra Cypern.
Detta är inte första gången någon med svenskt pass försöker utföra terrordåd mot israeliska mål. Hussein Idris, som arresterades i Thailand i januari 2012, misstänkt för att planerat att angripa israeliska mål med en bilbomb, hade också svenskt pass.