- Ökningen av antalet migranter, främst från Centralasien och Kaukasus, har ökat risken för etniska konflikter i Moskva, sade rysk-ortodoxa kyrkans högste ledare vid Moskvas stifts årliga möte den 20 december.
Han sade också att folk rekryteras av extremistorganisationer och att man i moskéerna eller omkring dem kräver ett jihad mot otrogna.
Många migranter har radikala åsikter och "rekryteras av terrororganisationer, ibland mitt i Moskva", sade Patriarken.
- Ofta provocerar de fram konflikter på etniska och religiösa grunder med målet att öka islamofobin, och följden är ett inflöde av nya medlemmar i deras organisationer, sade han vidare.
De radikala är extremt negativa till den ortodoxa tron, de har dödat sex ortodoxa präster, inklusive moskvaprästen Daniil Sysojev, de senaste 15 åren, sade Kirill.
Ryska kyrkans ärkebiskop sade att han hoppas att staden gör sig av med "laglösa enklaver, att problemen med illegal invandring och några invandrares oförskämda beteende ska lösa sig, att några sabotörers och extremisters aktiviteter kan tyglas," skriver Interfax.
Patriarken uppmärksammade också fall där ortodoxa flickor, som gift sig med muslimska män, mot sin vilja har hamnat i polygami. Om de skiljer sig från de muslimska männen tas barnen ifrån dem med våld och barnen uppfostras muslimskt.